A potencial biomarcador diagnóstico e prognóstico no câncer gástrico: uma análise in silico do gene GPNMB

Resumen

O câncer gástrico é o quinto mais comum e a terceira maior causa de morte por câncer no mundo. No estágio inicial os pacientes podem ser assintomáticos ou não apresentar sintomas específicos, dificultando o diagnóstico. Um estudo prévio identificou 39 genes com potencialidade de utilização como biomarcadores no câncer gástrico, entre eles o gene GPNMB. Nesse contexto, este trabalho teve como objetivo explorar o GPNMB como biomarcador prognóstico e diagnóstico para o câncer gástrico. Foram utilizados dados de expressão extraídos dos repositórios Gene Expression Omnibus (GSE33335 e GSE54129) e do The Cancer Genome Atlas (TCGA-STAD). A aquisição dos dados, o processamento e aplicação das análises estatísticas foram realizados com uma ferramenta de desenvolvimento próprio. Os algoritmos K-means e árvore de decisão foram aplicados para determinar o potencial como biomarcador diagnóstico do gene, enquanto que uma análise de sobrevida verificou a influência da expressão no prognóstico. A expressão de GPNMB foi maior em amostras de tecido tumoral quando comparadas com tecido não tumoral adjacente (NT). O K-means possibilitou a formação de grupos independentes com amostras normais e NT. De forma similar, com a árvore de decisão, as amostras foram corretamente classificadas em tecido normal e NT, de acordo com os valores de expressão. Além disso, as análises de sobrevida indicaram que a alta expressão do gene GPNMB está associada ao pior prognóstico. A pesquisa desenvolvida evidenciou o potencial do gene GPNMB como biomarcador para câncer gástrico, sendo esse demonstrado importante no desenvolvimento da doença.